1.对于已取消的资质存在纠纷隐患。例如园林绿化、物资资质、招标代理资质取消，合同双方可能会在前期的人才和社保费用方面约定不清，从而引发纠纷。
2.政策变动带来纠纷隐患。例如2017年9月西安市建委社保要求发生变动，今年建设厅5月18号对安全许可证办理新增了工伤统筹保险要求，5月23号对建造师养老保险提出新要求。政策变化带来成本变化，大包大揽的约定存在约定不清的隐患。
3.申办周期长产生隐患。由于资质申请周期长，不确定因素较多，有时需要不断完善资料，多次申报，多次审核，甚至存在不能通过审批的可能。
类似上述隐患，如果签订大包大揽服务合同，其所有风险均由资质代办公司承担，一旦产生纠纷，代理服务机构的投入可能会颗粒无收，轻则退款，赔付违约金，重则企业客户会提出由代办机构承担因资质办理逾期致使其未及时参与招标的连带责任（这类情况属于霸王要求，但现实过程中确实存在）。
因此资质代办机构需要在吃透政策、提升专业服务能力的基础上，按照政策要求，如实与客户沟通，建立规范、互信的合作关系，并在此基础上，本着专业、求实、为客户负责的态度订立代办协议。
在合同中容易出现错误，导致后期企业与代办机构产生纠纷，因此企业需要去找一家专业、正规的代办机构来进行合作。除此之外，企业应当认真了解合同内容，尽量把所有可能会出现的问题都列入合同之中，对双方都能起到一个规范和约束的作用，以免有什么遗漏之处造成损失。
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